幌舞作为煤矿产地曾繁华过，无奈现今人口衰减。幌舞支线也决定即将废线，停止使用。佐藤乙松（高仓健饰）是北海道地方支线幌舞车站的站长，乙松每天得独自负责剪票，用小旗指挥列车进站、出站，清扫车站内部以及其他琐碎工作。
老同事杉浦仙次造访幌舞车站，想游说乙松在退休后，和他一起去渡假村工作，可是遭到乙松的拒绝，他深信不移地用生命陪伴着铁路。由于坚守岗位，17年前夭折的女儿雪子和2年前去世的妻子静枝（大竹忍饰）都只能孤独地走向死亡，乙松强忍着心头疼痛。一天，一个小女孩出现，之后又有个小女生来找丢失的娃娃，在寒夜里，一个少女（广末凉子饰）出现，乙松这才突然记起她是谁……

石川启吾（金城武饰）是一位英俊潇洒、才华横溢的优秀音乐人，他的作品风靡全国，尤其受到年轻人的喜爱。然而他却因丧妻之痛将自己封闭起来，没人能走进他的内心世界。
女高中生真生是石川的万千崇拜者之一，某天她丢失了石川演唱会的门票，为了能看到偶像，真生不惜出卖肉体。这次经历改变了她的一生，她不幸感染上HIV病毒，在援助交际泛滥的高中里，真生无疑成了异类。所有的人都离她而去，在极度绝望之际，她邂逅了石川，两个失意之人的生命从此被紧紧绑在了一起……

槙子（山田優饰）是全家的骄傲：她优雅貌美，智力超群，还拥有人人羡慕的公务员金饭碗。可是美丽的外表之下，却是以自我为绝对中心，睚眦必报，自私自利，甚至“日行一恶”的恶魔本质。
相形之下，妹妹容子（志田未来饰）显得平凡得多了，她还是唯一知道姐姐真面目的人：打出生以来，容子就开始被姐姐欺负，可和姐姐的回合无一不是以落败告终，也只好乖乖成为姐姐役使的小奴隶，每日生活在被压迫和剥削的水深火热中。
让容子深感不可思议的是，槙子每回作恶却总是起到反效果，变本加厉的恶行总是会得到意外的好结局，槙子也因此被奉为“正义的伙伴”，愈加声名远扬……

哥斯拉掉入三原山之后，日本过了5年平安的日子，但是自卫队为了以防万一，打算以哥斯拉的细胞为成分制造对抗哥斯拉的武器"抗核细菌"(ANB)，以及将之前与哥斯拉对战时被摧毁的超级武器"Super_X"改造成为"SuperX2"，此时哥斯拉在三原山里居然又开始活动，使得日本关东地区地震不断，并且使得白神博士将自己女儿细胞跟玫瑰细胞混合的植物死亡，于是白神博士便加入ANB计划，同时他将哥斯拉细胞与女儿细胞跟玫瑰细胞混合的植物结合制造了不死植物碧奥兰蒂，但是在一次的事件当中碧奥兰蒂被释放出来并且在芦之湖巨大化。此时三原山爆炸，哥斯拉再度出现，自卫队无法阻挡哥斯拉往东京方向移动，后来出动了"SuperX2"使哥斯拉改变移动方向，但是在哥斯拉不间断的攻击之下"SuperX2也败下阵来，但是没有想到哥斯拉此时却朝着碧奥兰蒂的所在地移动.....